باشر قسم علم النفس التربوي عمله مع نشأة الجامعة، ويهدف إلى إعداد كوادر متخصصة مدربة في مجال التربية الخاصة، ويطرح القسم على مستوى البكالوريوس برنامج التربية الخاصة، كما طرح برنامج دبلوم العالي في الإدارة التربوية اعتباراً من الفصل الدراسي الأول 2009/2010, وبرنامج الدبلوم العالي في صعوبات التعلم اعتباراً من الفصل الدراسي الأول 2012 – 2013م، كما يمنح القسم درجة الماجستير في تخصص علم النفس التربوي. ويضم القسم (16) عضو هيئة تدريس، يحملون درجة الدكتوراه والماجستير في التخصصات التربوية المتعددة.